Amennyiben hírlevelünk nem jelenik meg helyesen, kérjük, kattintson ide!
2023 / 3 - NGS megoldások a Bio-Science-től

Tisztelt Ügyfelünk!

 

Cégünk elkötelezett a kortárs technológiák iránt, így természetesen az újgenerációs szekvenálás (NGS) területén is számos megoldást kínál különböző gyártóktól. Hírlevelünkben a teljesség igénye nélkül szeretnénk bemutatni az általunk forgalmazott releváns termékeket.

 

Intergrated DNA Technologies xGen™ NGS panelek, kitek, indexek, egyéb reagensek

 

Az Integrated DNA Technologies (IDT) neve jól ismert a molekuláris genetika területén: custom oligonukleotid szintézis területen világszinten piacvezetők és a cég hatalmas tapasztalatát most az újgenerációs szekvenálás területén is kamatoztatja.

Legyen szó akár teljes genom, akár hybrid capture, vagy amplikon szekvenálásról, az IDT predesigned és custom megoldásai a szakmai háttérrel tökéletes megoldást nyújtanak mind a leggyakrabb vizsgálatokban, mind egyedi igényekben!

Az xGen library prep kitek DNS és RNS minták mintatípusra optimalizált, enzimes és mechanikus fragmentációjú verzióiban elérhetőek: a széles spektrumú EZ/EZ UNI, a cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit, az ssDNA & Low-Input DNA Library Prep Kit, a kétféle RNA Library Prep Kit, valamint az egyedülálló Adaptase™ technológiát felhasználó Methylation-Sequencing DNA Library Preparation Kit mind az adott applikációban történő maximális hatékonyság elérésére lett kifejlesztve! Megtámogatva az IDT által a kezdetek óta jelen lévő Illumina-kompatibilis adaptereivel és indexing primereivel kiváló kombinációt képeznek a legmegfelelőbb könyvtárkészítés elősegítéséhez.

Az xGen Hybridization Capture technológia a célzott mágnesgyöngy alapú target capture workflow-hoz nyújt akár predesigned (a leggyakrabbi applikációk paneljei raktárról, pl. exom, örökletes betegségek, Pan-Cancer), akár custom megoldásokat; legújabb termékként pedig a Minimal residual disease (MRD) vizsgálatokhoz is teljes segítséget nyújt. A technológia összes szükséges reagense (pl. panelek, indexing primerek, Hyb&Wash kit, Blocker-ek, primer mix) elérhető a gyártó portfóliójában.

Az xGen Amplikon szekvenálási megoldása a multiplex PCR alapú megközelítéshez kínál ugyanúgy mind predesigned (legjellemzőbb területek: onkológia és örökletes betegségek, metagenomika, COVID), mind custom paneleket – természetesen a szükséges reagensekkel és indexing primerekkel.

Nem utolsó sorban pedig szeretnénk felhívni figyelmüket az NGS egyik leginkább munkaigényes területén, a normalizációban adható segítségünkről. A piacon egyedülálló xGen Normalase technológia alkalmazásával automatikus normalizációt biztosít a kiegyensúlyozott könyvtárak eléréséhez! Ehhez a technológiához csupán a Normalase modul és a speciális Normalase indexing primerek (az eredetiek helyett) szükségesek a klasszikus komponenseken kívül.

Keresse illetékes termékmenedzser kollégánkat:

Nagy Nándor, nagy.nandor@bio-science.hu, Mobil: +36 30 256 88 26

Vissza az oldal tetejére ↑

 

Nonacus cell-free DNA NGS panelek és egyéb megoldások

 

A liquid biopszia a manapság egyre divatosabb noninvazív diagnosztikai eljárások zászlóshajója – nem is érdemtelenül, hiszen fájdalmas, költséges és szükségtelen biopsziákat lehet vele elkerülni. A birminghami székhelyű Nonacus Limited a fő célkitűzésének ezen vizsgálati módszer Hyb Capture alapú megközelítésének optimalizálását tűzte ki célul. E technológiához már egészen az nukleinsav izolálástól kínál reagens kiteket és folyamatosan bővíti szoftveres támogatását is az egyes területekhez.

Kezdésnek hadd emeljük ki a CE-IVD minősített GALEAS Bladder Cancer Test-et, amely egy noninvazív alternatívát kínál a húgyhólyagrák NGS alapú dignosztizálására, így megelőzve sok szükségtelen cisztoszkópiát! A teszthez vizeletminta szükséges és megtalálható benne a mintavételi egység, az izoláló kit, a target capture-höz szükséges összes reagens és panel, valamint a GALEAS szoftver, amely célzott kiértékelést végez a szekvenálás adatai alapján.

A GALEAS szoftver a fenti panellel lett elsőként bemutatva, a Nonacus célkitűzése, hogy az összes többi panellel kompatiblis szoftverveziókat hozzon ki.

Jelen állás szerint a többi applikációhoz tartozó termékeket három kategóriába lehet sorolni.

Az első a Hyb Capture panelek, amelyek a könyvtárkészítés és a target capture minden szükséges elemét tartalmazzák. Jellemzően az onkológia (pl. Pan-Cancer, Tumor Exome), valamint a prenatális diagnosztika (pl. Nexome - a világon elérhető legnagyobb, 51Mb méretű exom panelje, vagy az ExomeCG, amely a chip technológia alapú citogenomikai vizsgálatokra kínál NGS alapú alternatívát) területét fedik le a cég predesigned paneljei, de a felhasználhatóságuk igen sokrétű – ráadásul itt is elérhetőek Custom Panelek.

Második termékcsaládjuk a nukleinsav izoláláshoz tartozó kiteket tartalmazza, ebből kétféle elérhető: a Cell3 Extract egy oszlop alapú, centrifugálást igénylő, manuális munkához ajánlott, míg a Bead Xtract cfDNA Kit egy mágnesgyöngyös, könnyen automatizálható kit, amelyek a cfDNS izolálására vannak optimalizálva – de jóformán bármilyen mintatípussal megbírkóznak.

Harmadik termékcsaládjuk a mintavételi csöveké, ebben a Cell3™ Preserver mintavételi cső található, amely barcode-olt, műanyag kivitelben képes szobahőmérsékleten akár 21 napig stabilizálni a mintában található cfDNS-t.

A Nonacus portfóliójában jellemzően a cfDNS-ről írtunk, de mivel ez az egyik legérzékenyebb mintatípus, az ahhoz szükséges eszközök szinte minden mintatípusra ugyanolyan jól alkalmazhatók.

Keresse illetékes termékmenedzser kollégánkat:

Nagy Nándor, nagy.nandor@bio-science.hu, Mobil: +36 30 256 88 26

Vissza az oldal tetejére ↑

 

MLPA, digitalMLPA géndiagnosztikai kitek és reagensek

 

A kópiaszám variációk (Copy Number Variations) számos, genetikai hátterű betegség esetében meghatározó szerepet játszanak, ezért gyors és pontos felderítésük a géndiagnosztikai vizsgálatok egyik kiemelt területe. Az MRC Holland betegségekkel asszociált CNV-k és metilációs mintázatok vizsgálatára alkalmas reagenseket és kiteket fejleszt. Kínálatukban egyaránt megtalálhatóak a nagy gyakorisággal előforduló genetikai rendellenességek és a ritka betegségek kimutatására alkalmas tesztek.

MLPA® (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) esszéik világszerte használatosak és a kópiaszám meghatározás standard módszerévé váltak a diagnosztika és a kutatás területén.

Az MRC Holland elkötelezett a folyamatos fejlesztés iránt. Jelenleg több mint 400 különböző MLPA esszét kínál DNS kópiaszám meghatározásra, mutáció azonosításra és DNS metilációs mintázat vizsgálatára. Olyan betegségekben, amelyeknél a CNV-k adják a mutációk jelentős, vagy meghatározó részét, az MLPA esszék az elsődleges tesztek. Ugyanez érvényes azokban az esetekben, amikor a genetikai analízist pszeudogének jelenléte nehezíti, mert az MLPA elég érzékeny technika ahhoz, hogy a rokon szekvenciák között különbséget tegyen. Az onkogenomikában az MLPA-t tumor profilozásra, a szomatikus CNV-k tanulmányozására használják.

A legújabb technológiai fejlesztés, az ún. digitalMLPA, amely az MLPA technológia és az NGS (Next Generatin Sequencing) ötvözése: megbízható, robosztus, ugyanakkor költséghatékony módszer a legmodernebb genetikiai diagnosztikában.

Míg az NGS során a CNV-k sokszor rejtve maradnak, a digitalMLPA hatékonyan segít ezek felderítésében. Ugyanazon a chipen, párhuzamosan futtathatók a digitalMLPA reakciók és NGS könyvtárak, így a digitalMLPA technológia az NGS időtakarékos és költségkímélő kiegészítése a CNV szűrésben.

A SALSA® digital Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (digitalMLPA) nagyon hasonló, mint az MLPA (alapja a próbák hibridizáció dependens ligálása), azzal a különbséggel, hogy egy multiplex PCR-t követően, Illumina platformon történő szekvenálás szükséges az amplikon kvantifikáláshoz.

digitalMLPA segítségével akár 1000 unikális szekvencia is vizsgálható egyetlen reakcióban (1000 különböző próba segítségével). Az adatelemzés az MRC Holland által ingyenesen biztosított kiértékelő szoftverrel (Coffalyser digitalMLPA), automatikus riportkészítéssel történik.

A digitalMLPA előnyei:

  • Validált CNV detekciós technológia
  • Mindössze 20 ng minta DNS szükséges
  • Beépített quality control próbák minden reakcióban
  • Egyszerű mintaelőkészítés, nem szükséges könyvtár kvantifikálás
  • Költséghatékony: akár 1000 próba egy reakcióban
  • Minta-biztonság: SNV próbák a minták biztonságos megkülönböztetéséhez
  • Könnyű analízis: felhasználóbarát adatelemzés az ingyenes Coffalyser digitalMLPA szoftverrel

Elérhető digitalMLPA applikációk:

Takarítson meg időt és pénzt: A digitalMLPA szimultán megoldás az NGS szekvencia analízisre és CNV kvantifikálásra, megelőzve így az NGS-negatív minták ismételt, időigényes vizsgálatának szükségességét.

Keresse illetékes termékmenedzser kollégánkat:

Sinkó Emese, PhD

sinko.emese@bio-science.hu

Mobil: +36 30 868 2483

Vissza az oldal tetejére ↑

Sikeres munkát kívánunk!
Vigyázzunk Magunkra, Vigyázzunk Egymásra!
A Bio-Science Kft. Csapata

Kérdése van? Írjon nekünk!
BIO SCIENCE

1119 Budapest, Fehérvári út 79.
Tel: (06-1) 619-8321 | Fax: (06-1) 799-0159
E-mail: bio-sci@bio-science.hu

© 2023 Bio-Science Kft. Minden jog fenntartva.

Valamennyi információ, dokumentum bármilyen formában történő megváltoztatása és/vagy bármilyen
formában történő ismételt megjelentetése, felhasználása TILOS a Bio-Science Kft
előzetes irásbeli hozzájárulása nélkül!

Hírlevelünkről minden hírlevelünk alján található leiratkozási link útján, esetleg postai úton (Bio-Science Kft. 1518 Budapest, Pf.: 129) tud leiratkozni
vagy írjon elektronikus levelet központi e-mail címünkre (bio-sci@bio-science.hu), melyben jelzi leiratkozási szándékát

Amennyiben le kíván iratkozni hírlevelünkről, kérjük kattintson ide!